Microfluidic chip fabrication in three-dimensional (3D) printer combined with loop-mediated isothermal amplification (LAMP) for detection of Salmonella spp.
نویسندگان
چکیده
Gıda ve çevresel kaynaklarda Salmonella'nın hızlı, güvenilir hassas tespiti, halk sağlığını korumak için çok önemlidir. LAMP yöntemi özel cihazlara deneyimli personele ihtiyaç duymaksızın uygulanabilecek bir yöntem olduğu son yıllarda sıklıkla tercih edilmektedir. LAMP’ın, mikroakışkan cihazlarla kombine edilmesi sınırlı kaynakların durumlarda, hızlı tanı testleri alternatifdir. Salmonella spp. tespiti için, üç boyutlu yazıcıda biyouyumlu PLA filament kullanılarak çip oluşturularak, ilmiğe dayalı izotermal amplifikasyon ile amaçlanmıştır. Mikroakışkan çipler CATIA V5 programı tasarlandı (Çip boyutları 15x12.5x2.4 mm, kanal çapı 850 µm) 3B üretildi. spesifik reaksiyonları InvA geni seçildi. kuru ısı bloğu kullanıldı protokolü 65℃’da 30 dak.’ydı. Testin duyarlılık, özgüllük, PPD NPD ölçümleri gerçekleştirildi.
 Kültür pozitif saptanan 25 numune arasında, mikrosantrifüj tüpünde uygulanan reaksiyonu sadece numunede yalancı negatif sonuc saptanmışken, üstünde reaksiyonunda ise iki olarak tespit edildi.
 Sonuç olarak; verilerimiz teknolojisinin birleştirilebileceğini, yazıcıların bu çiplerin üretimi sırasında kullanılabileceğini bize göstermiştir.
منابع مشابه
Microfluidic continuous flow digital loop-mediated isothermal amplification (LAMP).
Digital nucleic acid detection is rapidly becoming a popular technique for ultra-sensitive and quantitative detection of nucleic acid molecules in a wide range of biomedical studies. Digital polymerase chain reaction (PCR) remains the most popular way of conducting digital nucleic acid detection. However, due to the need for thermocycling, digital PCR is difficult to implement in a streamlined ...
متن کاملCombination of Microfluidic Loop-Mediated Isothermal Amplification with Gold Nanoparticles for Rapid Detection of Salmonella spp. in Food Samples
Foodborne diseases are an important cause of morbidity and mortality. According to the World Health Organization, there are 31 main global hazards, which caused in 2010 600 million foodborne illnesses and 420000 deaths. Among them, Salmonella spp. is one of the most important human pathogens, accounting for more than 90000 cases in Europe and even more in the United States per year. In the curr...
متن کاملDetermination of Herpetic Keratitis Frequency Using Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Method in Isfahan, Iran
Herpetic keratitis which is resulted from herpes simplex virus type I, is considered the most common cause of corneal blindness that needs being diagnosed and treated in order to prevent irreversible eye effects. The best method to diagnose it is molecular method which has high sensitivity and exclusivity. The current study was done on 25 eye samples collected from patients referred to the Feyz...
متن کاملElectric LAMP: Virtual Loop-Mediated Isothermal AMPlification
We present eLAMP, a PERL script, with Tk graphical interface, that electronically simulates Loop-mediated AMPlification (LAMP) allowing users to efficiently test putative LAMP primers on a set of target sequences. eLAMP can match primers to templates using either exact (via builtin PERL regular expressions) or approximate matching (via the tre-agrep library). Performance was tested on 40 whole ...
متن کاملDetermination of Herpetic Keratitis Frequency Using Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Method in Isfahan, Iran
Herpetic keratitis which is resulted from herpes simplex virus type I, is considered the most common cause of corneal blindness that needs being diagnosed and treated in order to prevent irreversible eye effects. The best method to diagnose it is molecular method which has high sensitivity and exclusivity. The current study was done on 25 eye samples collected from patients referred to the Feyz...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Etlik veteriner mikrobiyoloji dergisi
سال: 2022
ISSN: ['1016-3573']
DOI: https://doi.org/10.35864/evmd.1145433